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并非所有的土壤都被归类为矿物质土壤。有些是有机的，有不同的起源。有机土壤主要来源于有机物质的缓慢分解，主要是植物残体，形成于湿地、沼泽和浅水湖泊中沉积物的缓慢积累。有机土壤具有不同的结构，通常矿物质含量很低。

土壤不是岩石圈微生物的**重要栖息地。 现在可以检测到岩石区域表面之下非常深的微生物的存在，例如地下达3500米。 虽然细菌、真菌、原生动物和藻类可以在浅层发现，但细菌在深部也占主导地位。 麻豆国产视频网站还在沉积物、沉积岩、爆炸和断裂火成岩形成的透水地层中发现了微生物。 它们位于这些地层的多孔区域，或沉积颗粒或岩石的表面，在那里形成微生物浓度或生物膜。

细菌在形态学和物理学上有很大的差异。由于营养的限制，原位反应速率很低。但是麻豆国产视频网站仍然在岩石圈表面以下发现了许多生命的迹象。